Самый простой способ резервного копирования Ubuntu, кстати, именно эту возможность использует MintBackup в LinuxMint, это получение списка всех установленных пакетов.

Да, тут вы не сохраните всю конфигурацию, зато сможете очень быстро восстановить все установленные программы.

Если учесть, что большинство конфигурационных файлов находятся в домашней папке пользователя, а она не стирается при переустановке, то остальные файлы не такая уже большая проблема.

А такая резервная копия будет занимать всего несколько килобайт. Для выполнения резервной копии наберите такую команду:

$ dpkg --get-selections | grep -v deinstall > backup.txt

Далее, скопируйте полученный файл в надежное место. Когда система сломается, переустановите ее с установочного носителя, а затем просто выполните команды:

$ sudo dpkg --set-selections < backup.txt

$ sudo apt -y update

$ sudo apt-get dselect-upgrade

Файл со списком пакетов нужно поместить в текущую папку. Таким образом, вы очень быстро вернете все ранее установленные программы с минимальными затратами времени и в то же время получите чистую систему.